研究人员使用染色质免疫沉淀法，或 ChIP 在染色质环境下检测和表征蛋白与DNA的相互作用。Chip 实验可使用不同的输入样品，染色质碎裂法，并提供 ChIP-qPCR 或 ChIP-seq 读数。
ChIP 实验能否成功取决于染色质碎裂法，这也是 ChIP 实验步骤中较为关键的一步。通过超声处理或酶解法便可完成这一步。但是如何决定在 ChIP 实验中使用哪一种染色质碎裂法实验步骤呢？很多因素都会影响您的选择，做决定似乎很困难。因此，简单点吧！
在以下视频中，我们将通过四个问题来帮助您找到适合您实验需要的实验步骤以及来自 CST 的理想 ChIP 试剂盒。首先，您的输入样品类型是什么：细胞或组织？其次，IP 靶向的什么类型的蛋白? 组蛋白、转录因子以及辅因子可结合不同长度的 DNA，从而影响 ChIP 效率。
其他要考虑的因素包括您样品中靶标蛋白的丰度和您首选的染色质碎裂法。在许多情况下，您可以使用超声处理或酶解法。我们还会介绍一些某种染色质碎裂法优于其他方法的情况。