CST 博客: 实验室展望

Cell Signaling Technology (CST) 官方博客,我们在这里讨论您在实验台前工作时的期望,分享贴士、技巧和信息。

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了解细胞周期停滞发生的时间和原因对许多研究领域都至关重要,这些领域包括(但不限于)发育、衰老和癌症研究。

我们都知道,工具越好,产生的结果就越好,因此确保您有“衰老研究的十大靶标清单”中的所有基础工具。

编号 1:β-半乳糖苷酶染色试剂盒

已知衰老细胞以 pH 依赖性方式、尤其在 pH 6 时表达 β-半乳糖苷酶,1 我们全面的 Senescence β-Galactosidase Staining Kit #9860 包含检测 pH 6 时细胞或甚至冷冻组织中 β-半乳糖苷酶活性所需的一切。它非常适合快速便捷地检测多个细胞群或组织样品,方向简单明了,并且蓝色染色明亮清晰。

pH 为 6.0 的 β-半乳糖苷酶对未经处理和衰老的 MCF-7 细胞进行染色

使用 Senescence β-Galactosidase Staining Kit #9860,在 pH 6 时对未经处理的 MCF-7 细胞(左图)和经 etoposide #2200(12.5 μM, 24 小时)处理并允许其恢复 4 天的衰老 MCF-7 细胞(右图)进行 β-半乳糖苷酶染色。

编号 2:p53 和 磷酰-p53

肿瘤蛋白 p53 经如此充分地研究,从而几乎不需要介绍。p53 抑癌基因蛋白是 DNA 损伤应答 (DDR) 通路的主要参与者,也是细胞周期的关键调节因子。磷酸化 p53 的积累驱动细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂 (CDKI) 的激活,最终导致细胞周期停滞。使用衰老标记物 p53 进行免疫荧光分析

使用 p53 (7F5) Rabbit mAb #2527(绿色)对 HT-29 细胞进行共聚焦免疫荧光 (IF) 分析。肌动蛋白纤丝用 DY-554 Phalloidin 进行标记(红色)。

衰老细胞周期停滞高度依赖于磷酰-p53,后者积累并激活多种 CDKI。在 p53 和phospho-p53 水平之间进行比较分析通常是研究 DDR 通路和衰老的一个关键步骤。

使用衰老标记物磷酸化 p53 进行免疫荧光分析

使用 Phospho-p53 (Ser46) Antibody #2521(绿色)对未经处理(左图)或经依托泊苷(右图)处理的 MCF-7 细胞进行 IF分析。肌动蛋白纤丝用 DY-554 Phalloidin 进行标记(红色)。

编号 3:p21

最充分确立的衰老标记物之一 p21 是 p53 下游受调控的细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂 (CDKI)。与 CDK2 缔合时,p21 通过阻断细胞周期进入 G1/S 充当细胞周期抑制剂。

使用 p21 抗体对 MCF7 细胞进行免疫荧光分析

使用 p21 Waf1/Cip1 (12D1) Rabbit mAb #2947(红色)和 Phospho-Histone H3 (Ser10) (6G3) Mouse mAb #9706(绿色)对 MCF7 细胞进行免疫荧光分析。蓝色假色 = DRAQ5® #4084(DNA 荧光染料)。

编号 4:p16

另一种常见且可靠的衰老标记物 p16 是 CDKI INK4 家族的成员。它与 CDK4 和 CDK6 一起作用,以使细胞周期t停滞在 G1 期。3 据信 p16 的表达驱动细胞进入衰老。2

使用 p16 对 HeLa 和 HUVEC 细胞的提取物进行蛋白质印迹分析

使用 p16 INK4A (D3W8G) Rabbit mAb #80772(上图)或 β-Actin (D6A8) Rabbit mAb #8457(下图)对来自 HeLa 细胞和 HUVEC 细胞的提取物进行蛋白质印迹 (WB) 分析。

编号 5: LaminB1

衰老细胞通常显示出形态变化,使得 LaminB1 成为另一个有用的衰老指示分子。胞核形态标记物 LaminB1 的表达在衰老的人细胞和鼠细胞中丧失。4 LaminB1 丧失连同 p21p16 的积累增加都是典型的衰老标志。

使用 Lamin B1 和 β-肌动蛋白对 HT-29 细胞进行免疫荧光分析

使用 Lamin B1 (119D5-F1) Mouse mAb #68591(绿色)和 β-Actin (13E5) Rabbit mAb (Alexa Fluor® 647 Conjugate) #8584(红色)对 HT-29 细胞进行免疫荧光分析。蓝色伪彩 = Propidium Iodide (PI)/RNase Staining Solution #4087(DNA 荧光染料)。

编号 6:衰老相关分泌表型 (SASP)

衰老细胞有许多常见特征,但这些特征并不完全相同。每个衰老细胞群以独特的细胞因子、水平生长因子水平和蛋白酶水平为特征;这些水平称为衰老相关分泌表型 (SASP)。SASP 抗体小包装组合包含经验证用于各种应用的稳健抗体集合,这些应用包括蛋白质印迹法、免疫荧光法、流式细胞术和免疫沉淀法。该试剂盒可让您确定细胞群体的特定 SASP 概况。

对重组人 Interleukin-1β 进行蛋白质印迹法分析

使用 IL-1β (D3U3E) Rabbit mAb 对重组 Human Interleukin-1β (hIL-1β) #8900 进行蛋白质印迹分析。

编号 7:视网膜母细胞瘤蛋白 (Rb) 和磷酰-Rb

通常,视网膜母细胞瘤蛋白 (Rb) 的磷酸化为解除转录性靶标抑制作用并推进细胞周期必需。各种 CDKI(包括 p21 和 p16)抑制细胞周期,导致 Rb 过度激活并促进细胞周期停滞和衰老。4

使用 RB 抗体对 SH-SY5Y 细胞进行共聚焦免疫荧光分析的图像

使用 RB (4H1) Mouse mAb #9309(绿色)对 SH-SY5Y 细胞进行免疫荧光分析。肌动蛋白丝用 Alexa Fluor 555 phalloidin(红色)标记。

Rb 必须磷酸化才推进细胞周期,因此在衰老细胞中缺少磷酰-Rb。与 p53 一样,研究衰老时,对 Rb 和 磷酰-Rb 进行比较分析至关重要。

使用视网膜母细胞瘤蛋白 (Rb) 和磷酸化 Rb 进行共聚焦免疫荧光分析

使用 Phospho-Rb (Ser807/Ser811) (D20B12) XP® Rabbit mAb #8516(绿色),对未经处理(上图)或经 λ 磷酸酶处理(下图)的 MCF7(左图)细胞和 BT-549(右图)细胞进行免疫荧光分析。使用 DY-554 phalloidin(红色)标记肌动蛋白纤丝。蓝色伪彩 = DRAQ® #4084(DNA 荧光染料)。

编号 8:gamma-H2A.X

γ-H2A.X 是组蛋白 H2A 的一种变体,是典型的 DDR 通路标记物。当 DNA 受损时,H2A.X 在 Ser139 处发生磷酸化,形成 γ-H2A.X。5 这种修饰作为 DNA 损伤应答迅速稳健地发生,以标记修复所需的位点,使其成为研究 DDR 通路和衰老的有力工具。

使用 Phospho-Histone H2A.X 对未经处理或经过紫外线处理的石蜡包埋的 HT-29 细胞进行免疫组织化学分析

使用 Phospho-Histone H2A.X (Ser139) (20E3) Rabbit mAb #9718 对未经处理(左图)或经紫外线处理(右图)的石蜡包埋的 HT-29 细胞进行免疫荧光分析。

编号 9:53BP1

53BP1 巧妙地命名为 p53 结合蛋白 1,最初作为 p53 的结合伴侣鉴定,并提出其可以增强p53转录活性。6,7 53BP1 在 DNA 修复中起着至关重要的作用;已知它召集到 DNA 损伤部位,它在损伤部位的滞留依赖于 γ-H2A.X。8

使用 53BP1 Antibody 对 Hela 细胞进行共聚焦免疫荧光分析

使用 53BP1 Antibody #4937(绿色)对 Hela 细胞进行共聚焦免疫荧光分析。肌动蛋白丝已用 Alexa Fluor® 555 phalloidin(红色)标记。

编号 10: Ki-67

有时,检测某种物质的最佳方式是确定未起作用的物质。Ki-67 是一种作为细胞增殖标标记物频繁使用的胞核蛋白。这种检测范围从 G1 期到有丝分裂结束,但在细胞处于 G0 静息期时不存在。9 衰老细胞的一个标志是它们永久退出细胞周期,因此衰老细胞不表达 Ki-67。

使用 Ki-67 对人乳腺导管癌组织进行免疫组织化学分析

使用 Ki-67 (8D5) Mouse mAb #9449 对石蜡包埋的人乳腺癌组织进行 IF 分析。

衰老研究的抗体选择 

有很多衰老细胞标志物,那么为什么只选择一个呢?我们建议从 Senescence Marker Antibody Sampler Kit 开始,这款试剂盒含有这些功能性标记物中的多个标记物,非常适合用来检测您的衰老细胞! 

您还可以参考我们相互作用的 DNA 损伤反应 (DDR) 通路,以帮助识别相关靶标。

 

选择参考文献:

  1. Hernandez-Segura A, Nehme J, Demaria M. Hallmarks of cellular senescence. Trends in Cell Biology. 2018;28(6):436-453. doi:10.1016/j.tcb.2018.02.001
  2. LaPak KM, Burd CE. p16(INK4a) 在癌症和衰老中的分子平衡作用. Mol Cancer Res. 2014;12(2):167-183. doi:10.1158/1541-7786.MCR-13-0350
  3. He S、Sharpless NE。Senescence in Health and Disease. Cell. 2017;169(6):1000-1011. doi:10.1016/j.cell.2017.05.015
  4. Gorgoulis V, Adams PD, Alimonti A, et al. Cellular Senescence: Defining a Path Forward. Cell. 2019;179(4):813-827. doi:10.1016/j.cell.2019.10.005
  5. Sharma A, Singh K, Almasan A. Histone H2AX phosphorylation: a marker for DNA damage. Methods Mol Biol。2012;920:613-626. doi:10.1007/978-1-61779-998-3_40
  6. Iwabuchi K, Bartel PL, Li B, Marraccino R, Fields S. Two cellular proteins that bind to wild-type but not mutant p53. Proc Natl Acad Sci U S A. 1994;91(13):6098-6102. doi:10.1073/pnas.91.13.6098
  7. Ward IM, Minn K, Jorda KG, Chen J. Accumulation of checkpoint protein 53BP1 at DNA breaks involves its binding to phosphorylated histone H2AX. J Biol Chem. 2003;278(22):19579-19582. doi:10.1074/jbc.C300117200
  8. Wang B, Matsuoka S, Carpenter PB, Elledge SJ. 53BP1, a mediator of the DNA damage checkpoint. Science. 2002;298(5597):1435-1438. doi:10.1126/science.1076182
  9. Lawless C, Wang C, Jurk D, Merz A, Zglinicki Tvon, Passos JF. Quantitative assessment of markers for cell senescence. Experimental Gerontology. 2010;45(10):772-778. doi:10.1016/j.exger.2010.01.018
Tamar Aprahamian 博士
Tamar Aprahamian, PhD
Tamar Aprahamian 博士是 JetPub Scientific Communications 的创始人,为生命科学行业和学术机构提供战略支持和高质量的写作服务。她之前曾在学院和一家生物科技初创公司工作。除了担任资助研究部门和期刊的审稿人外,她还发表了 38 篇与她的研究项目相关的文章。Tamar 在塔夫茨大学生物医学科学研究生院获得细胞、分子和发育生物学博士学位。

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