在一次实验中使用多种抗体可为研究人员提供有用的信息。用多种抗体和细胞染料进行共染色是一种简单且低含量形式的多重分析。在细胞和组织中进行多重分析的技术是强大的研究工具，适用于一般细胞生物学研究及诊断目的。这些技术让研究人员能够检测多种生物标记物，以评估其样品。它们还可实现简单的共定位研究，以确定分析物之间的关系。
在这里，我们描述了在同一检测中使用多种抗体进行免疫荧光 (IF) 染色的两种常用技术。
下面是使用在不同宿主（例如，兔子和小鼠）中产生的抗体，进行间接 IF 的常规流程概述。请注意，根据特定产品的推荐实验步骤，实际实验步骤会有所不同。
使用间接 IF 染色方法和在不同宿主中产生的抗体的利弊如下：
左图：使用经 Anti-rabbit IgG (H+L), F(ab')2 Fragment (Alexa Fluor® 488 Conjugate) #4412 检测到的 α-Parvin (D7F9) XP® Rabbit mAb #8190（绿色）、经 Anti-mouse IgG (H+L), F(ab')2 Fragment (Alexa Fluor® 555 Conjugate) #4409 检测到的 Lamin A/C (4C11) Mouse mAb #4777（红色）和 DRAQ5® #4084（伪彩蓝色）对 SNB19 细胞进行染色。
中图：使用经 Anti-rabbit IgG (H+L), F(ab')2 Fragment (Alexa Fluor® 488 Conjugate) #4412 检测到的 AIF (D39D2) XP® Rabbit mAb #5318 （绿色）、经 Anti-mouse IgG (H+L), F(ab')2 Fragment (Alexa Fluor® 555 Conjugate) #4409 检测到的 EpCAM (VU1D9) Mouse mAb #2929（红色）和 DRAQ5® #4084（伪彩蓝色）对 MCF-7 细胞进行染色。
右图：使用经 Anti-rabbit IgG (H+L), F(ab')2 Fragment (Alexa Fluor® 488 Conjugate) #4412 检测到的 Caveolin-1 (D46G3) XP® Rabbit mAb #3267 （绿色）、经 Anti-mouse IgG (H+L), F(ab')2 Fragment (Alexa Fluor® 555 Conjugate) #4409 检测到的 Ki-67 (8D5) Mouse mAb #9449（红色）和 DRAQ5® #4084（伪彩蓝色）对 MCF-7 细胞进行染色。
下面是使用直接偶联不同荧光团的抗体进行直接 IF 染色的常规流程概述。请注意，根据特定产品的推荐实验步骤，实际实验步骤会有所不同。
使用直接 IF 染色法和偶联不同荧光团的抗体的利弊如下：