科学事业本应是薪火相传的集体智慧结晶——每一项新发现都建立在既往研究的基石之上。但如果这块基石本身存在裂痕呢?
Entrop 团队近期发表于《自然》杂志的论文在学术界掀起轩然大波,该论文对一款上市数十年且被广泛使用的单克隆抗体试剂提出质疑,使得依赖这款试剂的 1,500 余篇研究成果面临可信度危机。论文中,研究者证实这款本用于检测 Bcl-2 相关 X 蛋白 (Bax) 的试剂,会与某种分子量与 Bax 相同的蛋白发生非特异性结合。通过严谨的验证实验,最终确认该蛋白并非 Bax。
令人忧心的是,截至 2025 年 4 月,在这篇颠覆性论文发表四个月后,问题抗体仍在公开销售——产品页面赫然标注着 4.6/5 星的高分评价。
破碎的认知:我们对关键蛋白 Bax 的科学理解是否全盘皆错?
作为调控细胞凋亡的核心蛋白,Bax 被认为与神经系统疾病、癌症、自身免疫炎症及心血管事件等多种病理过程密切相关。
至少科学家们原本是这样认为的。但当检测 Bax 的抗体实际结合的竟是完全不同的蛋白时,这些结论恐怕都需要重新审视。
在《为何 1400 余项研究中 Bax 检测结果可能存疑》一文中,作者 Kristin Entrop、Senait Wieske 和 Markus Rehm 证实,在 Bax 基因敲除与缺陷型细胞中,Santa Cruz Biotechnology 的 Bax 抗体 (B-9):sc-7480(以下简称“Santa Cruz 抗体”)“在免疫印迹实验中仍会在 Bax 预期分子量位置呈现假阳性信号,基于免疫荧光的 Bax 表达检测同样存在误判”。
图 1. 如图所示,蛋白质印迹显示亲代细胞与 Bax 缺陷型细胞的全细胞提取物检测信号,GAPDH 作为上样对照。(图片来源:Entrop, K. et al, Why Bax detection in >1400 publications might be flawed. Cell Death & Disease (2024), Published under CC by 4.0.)
相比之下,Entrop 论文作者指出,Cell Signaling Technology 试剂 Bax Antibody #2772 能够清晰显示相应 Bax 缺陷细胞中 Bax 表达的缺失情况(见上图 1)。
Entrop 团队进一步通过 siRNA 实验证实:Santa Cruz 抗体不仅在免疫印迹中错误识别了与 Bax 分子量相近(约 25kDa)的非特异性蛋白,而且完全未能检测到真正的 Bax 蛋白(即在预期分子量位置并未出现双重信号叠加)。具体数据与实验细节请参阅 Entrop 论文。
Bax 在细胞凋亡中的作用作为诱导性凋亡(清除损伤或病变细胞的程序性死亡过程)的关键调控因子,Bax 蛋白在细胞应激状态下会从胞质转位至线粒体,协助形成线粒体外膜孔隙。这一过程导致细胞色素 c 等凋亡因子释放,进而激活 caspase 级联反应并引发细胞死亡。
Bax 在癌症研究中尤为重要——它扮演着抑癌基因的角色;同时在神经退行性疾病领域,过度凋亡导致的神经元丢失也与 Bax 密切相关。 CST 为您提供值得信赖的 Bax 抗体
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“探究 Bax 在凋亡中功能的研究,往往需要精确测量其在各类细胞应激状态下的表达量及亚细胞定位,”CST 高级研发科学家 Gary Kasof 博士解释道,“使用非特异性抗体将导致数据失真——当检测试剂实际识别的是无关蛋白时,研究不仅无法揭示 Bax 的真实功能,还可能错误质疑其他已确证 Bax 功能的可靠研究。”
这意味着,使用 Santa Cruz 抗体的 1,500 余项研究,其结论准确性均需重新评估。
劣质研究抗体的代价
据开放式科学抗体表征计划 YCharOS(发音同“Icarus”)估算,无效抗体的使用每年造成约 10 亿美元研究经费的浪费。该组织致力于评估市售研究抗体的可靠性。1
“YCharOS 的测试表明,许多商业抗体的实际性能与宣传不符——它们要么无法识别目标蛋白,要么会同时识别非目标蛋白,”YCharOS 联合创始人 Carl Laflamme 博士解释道,“我们采用应用导向的抗体表征策略,平均每个靶标评估 15 种抗体。好消息是,针对每个已验证的应用场景,我们通常能筛选出 1-2 种特异性强、可靠性高的优质抗体。”
然而,由于缺乏标准化的抗体验证与比对机制,研究人员往往难以判断所依赖的试剂能否按预期发挥作用。YCharOS 发现,经测试性能不佳的抗体中,有数百种已被用于同行评议论文,并估算“文献中 20-30% 的实验图像来自无法特异性识别目标蛋白的抗体”。1
这种抗体验证缺失的代价不仅由使用它们的研究人员承担,更将影响整个科学界——既包括浪费实验耗材的巨额开支,也涉及研究人员耗费数月乃至数年时间进行故障排查、错误数据分析以及重复失败实验所产生的人力成本。
使用重组单克隆抗体 Bax (D3R2M) Rabbit mAb #14796 对石蜡包埋的小鼠肺脏组织进行免疫组织化学分析。
科研经费的巨大浪费同样不容忽视。尽管具体数额差异较大,但保守估计每项研究的平均成本介于 10 万至 75 万美元之间。2以 Bax 抗体为例,Entrop 论文对 1,500 多篇研究文章有效性提出的质疑,意味着 1.5 亿至 12.5 亿美元的研究资源被错误配置和浪费。
但这仅仅是冰山一角。难以计数的研究人员耗费大量时间与精力审阅存疑数据,甚至可能试图复现错误结论。更严重的是,基于错误研究得出的失实结论,还可能导致后续研究被延误、中止、取消或错误设计。
上述成本及浪费估算主要基于对学术研究人员的影响,但药物研发和临床研究同样面临可重复性问题的困扰。Begley 和 Ellis 的一项具有里程碑意义的研究显示,53 项“突破性”临床前研究中仅有 6 项能够被成功复现。3 虽然科学可重复性危机存在多种诱因,但低质量或未充分验证的研究试剂被认为是重要因素之一。4 据估算,每年约有 280 亿美元被浪费在不可复现的临床前研究上,5 这不仅造成资金损失,更让研究人员在错误的方向上空耗精力。
每一分花在劣质抗体上的经费,都意味着突破性发现的资金被剥夺。
“劣质抗体造成的后果看似只是理论推演,但请记住这关系到无数研究人员的切身利益,”CST 抗体应用与验证高级总监 Katherine (Katie) Crosby 表示,“当辛劳得来的成果因试剂问题被迫撤回,这种打击令人心碎。更令人愤慨的是,错误竟源于厂商出售的缺陷产品。这正是 CST 如此执着于抗体验证的原因——我们本身就是科学家。我们既在乎科学的严谨性,也关心每一位研究人员的付出。”
严格抗体验证的必要性
本博客虽然只探讨了一款失效抗体,但令人忧心的是,这种情况绝非个例。事实上,YCharOS 针对神经科学相关蛋白抗体的初步分析显示,高达三分之二的试剂实际性能与厂商宣称不符1
根据 YCharOS 的初步分析,目前全球近 350 家供应商提供的约 770 万种研究抗体产品中,可能有超过 500 万种抗体无法在实验中达到预期效果。
“尽管劣质抗体泛滥,但市场上仍存在优质选择,比如 Bax 抗体,”Laflamme 指出,“关键在于选择领先制造商的抗体产品,仔细审阅厂商提供的验证数据,并在实验室内进行预测试以确保试剂能够在您的实验中发挥作用。”
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博客: 您是否信任您的研究抗体? |
作为历史最悠久的抗体制造商之一,CST 的抗体试剂目录却相对精简——13,500 种抗体,与其他厂商超 10 万种的规模形成鲜明对比。正是这种克制让我们能够 100% 确保每款抗体的特异性和可靠性。严苛的验证标准虽需投入更多时间精力,但我们坚信这份坚持值得。正因如此,我们敢保证 CST 抗体每次都能精准发挥预期功能。
“细胞本质上如同‘黑匣子’,我们依赖抗体等工具抽丝剥茧地解析其内部机制,”Crosby 补充道,“既然无法直接观测,确保实验工具如预期般工作就显得至关重要。”
二十五年来,CST 科学家始终恪守“追求卓越科学”这一不变准则,树立了抗体质量的黄金标准。为抗体性能设定了标准。作为一家由专注的科学家创立、领导并组成的公司,我们比任何人都清楚:研究人员需要的,是能够精准兑现承诺的实验工具。
详细了解 CST 的抗体验证:
选择以下参考文献
- Ayoubi R, Ryan J, Biddle MS, et al. Scaling of an antibody validation procedure enables quantification of antibody performance in major research applications. Elife. 2023;12:RP91645. Published 2023 Nov 23. doi:10.7554/eLife.91645
- Reference NIH’s Biomedical Research and Development Price Index
- Begley CG, Ellis LM. Drug development: raise standards for preclinical cancer research. Nature. 2012;483:531–533.
- Baker, M. Reproducibility crisis: Blame it on the antibodies. Nature 521, 274–276 (2015). https://doi.org/10.1038/521274a
- Freedman LP, Cockburn IM, Simcoe TS. The Economics of Reproducibility in Preclinical Research [published correction appears in PLoS Biol. 2018 Apr 10;16(4):e1002626. doi: 10.1371/journal.pbio.1002626.]. PLoS Biol. 2015;13(6):e1002165. Published 2015 Jun 9. doi:10.1371/journal.pbio.1002165